Die dritte Saison begann erstmals mit der Pre-Season am 08. Februar mit dem Wild Card-Spiel im SuperiorBowl #1. Im SuperiorBowl, der am 22. Februar in Astoria City sein Finale hatte, trafen die besten Spieler der Conferences gegeneinander an.
SuperiorBowl #1
Datum Begegnung Zeit/Ergebnisse Austragungsort Young - Brady 28 - 15 Lombardi — Young 39 - 3 Madden — Thorpe 16 - 22 Lombardi — Thorpe 0 - 13
Der erste Spieltag der Regular Season wurde am 28. Februar 2016 mit neun gleichzeitig stattfindenden Spielen ausgetragen. Während der Regular Season wurden an den Spieltagen 1 bis 9 erstmals auch Monday Night Games durchgeführt.
Regular Season 2016
Nach zehn Wochen war die Regular Season beendet. Der beste Conference-Champion gewann die Walter Camp-Trophy und besetzte für die Play Offs den Rang 1. Die Ränge 2 bis 5 belegten – je nach Leistung – die übrigen Conference Champions. Die fünf Runner Ups belegten je nach Leistung die Ränge 6 bis 10.
Walter-camp-trophy
Die Play Offs fanden mit den Wild Card-Spielen und anschließenden Viertel- und Halbfinale ab dem 08. Mai, mit jeweils einem Monday Night Game statt. Der III. Memorial Bowl fand im Stadion des zweiten AFL-Super Bowl-Champions in Hambry am Memorial Day, den 30. Mai 2016 statt.